Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med27Q9DB40 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms