Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn3Q9DAW9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn3Q9DAW9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn3Q9DAW9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn3Q9DAW9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn3Q9DAW9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn3Q9DAW9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms