Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms