Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sgf29Q9DA08 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms