Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms