Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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