Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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