Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms