Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms