Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nop56Q9D6Z1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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