Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms