Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tube1Q9D6T1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tube1Q9D6T1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tube1Q9D6T1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tube1Q9D6T1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tube1Q9D6T1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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