Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms