Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms