Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms