Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc7Q9D541 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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