Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms