Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms