Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms