Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms