Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chordc1Q9D1P4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms