Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms