Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms