Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Stx17Q9D0I4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Stx17Q9D0I4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx17Q9D0I4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Stx17Q9D0I4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Stx17Q9D0I4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Stx17Q9D0I4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Stx17Q9D0I4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx17Q9D0I4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms