Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms