Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Shmt2Q9CZN7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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