Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc77Q9CZH8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms