Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsfl1cQ9CZ44 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsfl1cQ9CZ44 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms