Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms