Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrs1Q9CYH6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms