Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mis12Q9CY25 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mis12Q9CY25 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mis12Q9CY25 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mis12Q9CY25 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mis12Q9CY25 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms