Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl11Q9CXW4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms