Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms