Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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