Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prps2Q9CS42 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prps2Q9CS42 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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