Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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