Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms