Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms