Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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