Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Q9CQC3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q9CQC3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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