Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pole4Q9CQ36 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pole4Q9CQ36 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pole4Q9CQ36 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms