Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Chmp3Q9CQ10 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms