Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cntnap4Q99P47 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntnap4Q99P47 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms