Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms