Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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