Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ms4a6cQ99N08 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ms4a6cQ99N08 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ms4a6cQ99N08 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ms4a6cQ99N08 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms