Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms