Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PtprtQ99M80 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PtprtQ99M80 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtprtQ99M80 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtprtQ99M80 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprtQ99M80 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprtQ99M80 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PtprtQ99M80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PtprtQ99M80 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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