Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rcbtb2Q99LJ7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms