Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pacsin3Q99JB8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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